BIOLMOL3

 0    211 schede    chomikmimi
Scarica mp3 Stampa Gioca Testa il tuo livello
 
Domanda język polski Risposta język polski
Ile % dna koduje białka?
inizia ad imparare
nie więcej niż 2 %
co koduje dna, które nie koduje białka
inizia ad imparare
produkuje różne typy RNA lub nie jest transkrybowana w ogóle i pełni prawdopodobnie funkcje regulatorowe
Acetylacja białek
inizia ad imparare
przyłączanie grupy acetylowej COCH3
Czego dotyczy acetylacja białek?
inizia ad imparare
Reszt lizynowych w N-końcowym fragmencie histonu
Czym skutkuje acetylacja białek?
inizia ad imparare
Zmianą w strukturze nukleosomu i rozluźnieniem chromatyny
Co ma podobny efekt jak acetylacja?
inizia ad imparare
Fosforylacja białek histonowych
Co jest przeciwne do acetylacji?
inizia ad imparare
Deacetylacja i metylacja, tam większa kondensacja chromatyny
Na co wpływa metylacja cytozyn w DNA?
inizia ad imparare
Na zmiany w strukturze chromatyny wykluczających jej transkrybcję
Co to enhancer i silencer?
inizia ad imparare
Specyficzne czynniki transkrybcji, aktywują niektóre geny na określonym etapie rozwoju
Co robią specyficzne czynniki transkrypcji? gdzie się wiążą
inizia ad imparare
Wiążą się z DNA nie w obrębie promotora, ale w specyficznych sekwencjach.
Specyficzny czynnik transkrypcji wzmacniający aktywność trankskrybcyjną
inizia ad imparare
enhancer
specyficzny cynnik transkrybcji obniżający aktywnosc tranksrybcyjna
inizia ad imparare
silencer
Jedna sekwencja wyciszająca/wzamacniająca odpowiada czemu?
inizia ad imparare
Tylko JEDNEMU GENOWI
Czym się różnią specyficzne czynniki transkrybcji od promotorów?
inizia ad imparare
Wpływają na transkrybcję nawet w dużej odległości od genu, Działą równie efektywnie bez wględu na polarność
Dziedziczenie epigenetyczne - pozagenowe, co t o
inizia ad imparare
sposób kodowania przez strukturę chromatyny
jak jest przekazywana infromacja genetyczna w dziedziczeniu epigenetycznym - pozagenowym
inizia ad imparare
Jest przekazywana tak, jak ta zakodowana w zasadach azotowych
Dlaczego jedno z bliźniąt może mieć chorobę genetyczną, a drugie nie?
inizia ad imparare
bo dziedziczenie epigen. pozagenowe - bo bedzie ta choroba zwiazana nie z budową dna, ale z ułożeniem chromatyny
Imprinting genomowy zaliczany jest do jakiego dziedziczenia?
inizia ad imparare
Dziedziczenia epigenetycznego pozagenowego
Inaktywacja chromosu X jest zaliczana do jakiego rodzaju dziedziczenia?
inizia ad imparare
Do dziedzidzenia epigenetycznego pozagenowego
Dziedziczenie epigenetyczne jest odpowiedzialne za jakie choroby?
inizia ad imparare
Zespoł Angelmana, Pradera-Willego, Łamliwego chromosmu X
Co to motyw palca cynkowego?
inizia ad imparare
najczęściej występująca struktura w eukaroitycznych czynnikach transkrybcyjnych
Do czego należy motyw palca cynkowego?
inizia ad imparare
Do domen wiążących
Co robią aminokwasy z motywie palca cynkowego?
inizia ad imparare
z ok. 30 aminokwasów, cześć z nich tworzy pętle, związana u podstawy przez 4 reszty aminokwasowe.
Atom cynku - motyw palca cynowego
inizia ad imparare
Atom cynku jest związany w sposób koordynacyjny
Do wiązania DNA niezbędna jest jaka ilość palca cynkowego?
inizia ad imparare
niezbędna ilość 3 i więcej takich motywów.
Gdzie jest obecny motyw palca cynkowego?
inizia ad imparare
w TFIIA, Białku Sp1, białku będącym receptorem hormonów steroidowych
Progeria co to
inizia ad imparare
Zespół Hutchisona-Gliforda
Czym jest spowodowana progeria?
inizia ad imparare
Alternatywnym splicingiem. Odpowiedzialny gen Imna i niekatywna lamina A
co koduje gen Imna?
inizia ad imparare
laminę A i C które powstają z alternatywnego splicingu pierwotnego Imnami
miRNA co to
inizia ad imparare
endogenne, ok 20-nukelotydowe niekodujące cząsteczki RNA
Co regulują miRNA?
inizia ad imparare
Regulują ekspresję ok 30% genów
Każde z miRNA reguluje ekspresję ilu genów?
inizia ad imparare
100-200
Na jakich chromosomach miRNA?
inizia ad imparare
na wszystkich z wyjątkiem Y + w intronach kodujących i niekodujących RNA, w eksonach niekodujących mRNA i w 3' regionach mRNA niepodlegających translacji
Dzięki czemu 2 nici miRNA?
inizia ad imparare
dzięki rybonukleazie Dicer=polimeraza RNA III
Szlak rozwoju miRNA
inizia ad imparare
Pri-mikroRNA->Pre-mikroRNA->do cytoplazmy(eksportyna 5, białko ran)->2 nici miRNA
W czym bierze udział miRNA?
inizia ad imparare
w interferencji
co robi miRNA?
inizia ad imparare
Wycisza ekspresje genów poprzez tłumienie translacji
Regulacja cyklu komórkowego - co odpowiedzialne
inizia ad imparare
miRNA
Różnicowanie proliferacji i migracji komórek, różnicowanie tkanek - co odpowiedzialne
inizia ad imparare
miRNA
Apoptoza - co odpwoiedzialne
inizia ad imparare
miRNA
Organogeneza i homeosteaza komórek i tkanek
inizia ad imparare
miRNA
powstawanie i różnicowanie limfocytów B, t - co odpowiedzialne?
inizia ad imparare
miRNA
Regulacja mechanizmów wrodzonej odpowiedzi immunologicznej - co odpowiedzialne
inizia ad imparare
miRNA
Patogeneza nowotworów - wyciszanie onkogenów/genów supresorowych - co odpowiedzialne?
inizia ad imparare
miRNA
co to HEM?
inizia ad imparare
grupa prostetyczna enztmów
co przy braku hemu
inizia ad imparare
Hamowana translacja genów globiny
Za czyim pośrednictwem działa HEM?
inizia ad imparare
inhibitora kontrolowanego przez hem - JCR
HCR. jaka aktywnosc?
inizia ad imparare
ma aktywnosc kinazy w stosunku do czynnika Eif-2
Co powoduje ufosforylowany HCR?
inizia ad imparare
powoduje represję inicjacji translacji
Gdzie może występować korepresor?
inizia ad imparare
np. w operonie tryptofanowym, który syntetyzuje tryptofan
Co, kiedy tryptofan jest obecny? (korepreso)
inizia ad imparare
łączy się z represorem i powoduje zatrzymanie transkrypcji genów struktury i tryptofan nie jest syntezowany
Tryptofan, budowa
inizia ad imparare
2 pierścienie i grupa CH2 i NH
Geny struktury
inizia ad imparare
każdy gen poza regulatorowym
Lac Z
inizia ad imparare
Beta-galaktozydaza (rozkład laktozy na glukozę i galaktozę, przy niskim poziomie - konwersja laktozy w allolaktozę)
Lac Y
inizia ad imparare
permeaza galaktozydowa(transport przez ścianę komórkową)
Lac A
inizia ad imparare
transacetylaza tiogalaktozydowa(przyłącza grupę acetylową do laktozy z acetylokoenzymu A)
Olac
inizia ad imparare
miejsce operatorowe, między -5, +21, przy końcu 5' Operonu laktozowego. Wiąże białko represor łac, które po związaniu z operatorem jest inhibitorem transkrypcji
Promotor Plac
inizia ad imparare
nie jest silny (nie zawiera silnej sekwencji -35)
Co powoduje spadanie ilości cAMP w komorce?
inizia ad imparare
Glukoza
co przez brak glukozy (a camp?)
inizia ad imparare
rośnie poziom cAMP, powstaje kompleks CRP-cAMP, łączy się pLAC, zgięcie DNA o 90 stopni
Represor lac
inizia ad imparare
wiąże się z operatorem, jest silnym inhibitorem transkrypcji, kodowany prez oddzielny regulatorowy gen lacl, wchodzi w skład operonu, str. 5'
Laktoza obecna jako jedyne źródło C
inizia ad imparare
ekspresja lacXYA na wysokim poziomie, enzymy potrzebne do trawienia są wytwarzane
Inne źródła C obecne(glukoza)
inizia ad imparare
ekspresja lacXYA na bardzo niskim poziomie
Allolaktoza
inizia ad imparare
wiąże się z represorem, redukuje jego powinowactwo, pozwala polimerazie rozpocząć transkrybcję
Induktory (lac)
inizia ad imparare
allolaktoza, izopropylo-beta-D-tioglikozyd (IPTG)
Jaki jest transkrypt lacXYA?
inizia ad imparare
niestabilny
co wzmacnia białko CRP?
inizia ad imparare
wiązanie polimerazy RNA
TRP:
inizia ad imparare
5 genów, wielkość transkryptu 7kpz, synteza tryptofanu
Operator Otrp
inizia ad imparare
między -21 a 3, centrum miejsca wiązania palindromowe, 18 pz
Represor trpR
inizia ad imparare
Aktywny po przyłączeniu tryptofanu, produkt oddzielonego operonu, zmienjsza inicjacje około 70 razy
Tryptofan w operonie trp
inizia ad imparare
Korepresor, inhibuje swojąwłasną syntezę
Atenuator
inizia ad imparare
sekwencja miedzy koń. transkryb. sek. lid. (162nt długość) a regionem kodującym gen trpE, miejsce terminacyjne rho-niezależne, krótki rejon palindromowy G-c,
Co po krótkim rejonie palindromowym G-c?
inizia ad imparare
8 cząsteczek U
Liderowa sekwencja RNA operonu trp
inizia ad imparare
mają komplementarne sekwencje, mogą tworzyć różne sprowane struktury RNA
sprowanie sekwencji 1:2
inizia ad imparare
powstanie drugiej spinki
Sparowanie sekwencji 3:4
inizia ad imparare
powstanie spinki atenuacyjnej
sprowanie sekwencji 2:3
inizia ad imparare
powstanie spinki(antyterminacyjna), uniemożliwia powstanie spinki atenuacyjnej
Peptyd liderowy
inizia ad imparare
określenie stęż dostępnego tryptofanu, 14 aminokwasów
przez co jest kodowany peptyd liderowy?
inizia ad imparare
27-68 nukleotydy liderowego RNA
Co się dzieje przy niedoborze peptydu liderowego?
inizia ad imparare
Zatrzymuje śię translacja, rybosom zatrzymuje sie.
Regulacja ekspresji genów u prokaryota (jakie rodzaje)
inizia ad imparare
Na poziomie transkrypcji, translacji i regulacja aktywności koncowego produktu danego genu
RegRegulacja ekspresji genow u prokaryota regulacja aktywnoci koncowego produktu danego kgenu
inizia ad imparare
posttrankrypcyjna modyfikacja produkowanych białek
Regulacja ekspresji genow u prokaryota na poziomie transkrybcji
inizia ad imparare
regulacja lliczby wytworzonego mRNA
Regulacja ekspresji genow u prokaryota na poziomie translacji
inizia ad imparare
regulacja liczby kopii łańcuchó polipetydowych
Regulacja może być:
inizia ad imparare
wewnętrzna i zewnętrzna
Regulacja zewnętrzna ekspresji genów u prokariota
inizia ad imparare
Poziom tranksrypcji danego genu zależt od czynników zewnętrznych, zwykle dotyczy genów zawierających silne promotory
Gdy tranksrypcja jest kontrolowana stopniem oddziaływania pomiędzy polimerazą RNA i promotorem genu, jaka regulacja?
inizia ad imparare
Wewnętrzna
Jaka regulacja jest wynikiem długiej ewolucji promotorów
inizia ad imparare
wewnętrzna
Jaka regulacja, gdy gdeny zawierające promotory słabe wykazują niski poziom ekspresji genów (co 10 min)
inizia ad imparare
wewnętrzna
Sekwencje genów -10 i -35, jaka regulacja
inizia ad imparare
wewnętrzna
Na co nie pozwala regulacja wewnetrzna?
inizia ad imparare
na adaptację poziomu syntezy białek w zależności od krótkotrwałych zmian metabolizmu komórkowego
Promotory silne - Regulacja wewnetrzna
inizia ad imparare
Promotory silne indukują z większą częstością nawet co 2 sekundy
Białka bakterii syntetyzowane w sposób ciągły
inizia ad imparare
Białka błon komórkowych, rybosomów, regulatorowe
Operon - definicja
inizia ad imparare
jednostka prokariotycznej ekspresji genów, która zawiera geny struktury i Elem. kontrolne rozpoznawane przez produkty genu regulatorowego
Cistron - definicja
inizia ad imparare
gen strukturalny przylegajacy do operonu, koduje bialko
Sekwencje odpowiedzialne za regulację tranksupcji operonow to:
inizia ad imparare
operator, promotor, i regulator
operator
inizia ad imparare
odcinek, który rozpoznaje i przyłącza białko represorowe. Położony bezpośrednio pod pierwszym genem stuktury
Promotor
inizia ad imparare
Od niego zaczyna się synteza mRNA, w jego budowanie 2 regiony: miejsce przyłączania cyklicznegoAMP i m.p. polimerazy RNA
Regulator
inizia ad imparare
Gen kontrulujący synteze bialek na drodze wytwarzania represora
Co modyfikuje konformację represora?
inizia ad imparare
Korpresory i induktory, zmieniają powinowactwo do sekwencji regulatorowej
Represor - co reguluje
inizia ad imparare
Ekspresjęinnego genu na poziomie transkrypcji
Reprosor - co blokuje
inizia ad imparare
Transkrypcję genu, wiążac się z jego operatorem
Połączenie represora z operatorem - co uniemożliwia
inizia ad imparare
Uniemożliwia cząsteczce polimerazy połaczenie z promotorem i przemieszczanie się wzdłuz regionu kodujacego genu
Czym są czasteczki represorow?
inizia ad imparare
Białkami allosterycznymi
Allosteria
inizia ad imparare
Zdolność białek do zmiany konfromacji w wyniku przyłączenia efektora allosterycznego
Gdzie przyłączają się efektory?
inizia ad imparare
W innym miejscu niż centrum aktywne
Regulacja ekspresji genów różnego typu operonów za pomocą allosterycznych białek polega na?
inizia ad imparare
Na blokowaniu(tryptofan) lub umożliwaniu transkrypcji (laktoza)
Jakie są dwa typy operonow?
inizia ad imparare
Anaboliczne (ulegające represji) i kataboliczne (indukowane)
Anaboliczne operony
inizia ad imparare
Enzymy odpowiedzialne za szlak anaboliczny są produkowane wtedy, gdy substancja syntetyzowana nie istnieje w komorce
Co umożliwiają geny Lac Z, lac Y, lac A?
inizia ad imparare
katabolizm laktozy
Gdzie są transkrybowane geny Lac Z, lac Y, lac A?
inizia ad imparare
na jedna, wspolna nic mRNA
Co blokuje rozpoczęcie transkrpycji genow Z, Y, A?
inizia ad imparare
Represor wiążąc się z operatorem, bo uniemożliwia przyłączenie polimerazy RNA do promotora
Co umożliwa przyłączenie polimerazy RNA do promotora?
inizia ad imparare
Induktor, bo wiążę się z represorem i powoduje jego odłączenie od operatora. Induktor wykonuje derepresję operonu lac ZYA.
Co robi podjednostka sigma?
inizia ad imparare
Zwiększa powinowactwo polimerazy RNA do promotora
Atenuacja
inizia ad imparare
Kontrola transkrypcji przez translację
Długość atenuatora operonu trp
inizia ad imparare
162 pz
gdzie znajduje się atenuator operonu trp?
inizia ad imparare
w sekwencji literowej operonu trp
Co poprzeda kodon inicjujący fen trp E?
inizia ad imparare
atenuator operonu trp
Co decyduje w operonie tryptofanowym, czy transkrypcja ulegnie wcześniejszej terminacji(atenuacji)?
inizia ad imparare
Stężenie tryptofanu
Co umożliwia mechanizm atenuacji?
inizia ad imparare
Umożliwia 10krotne zwiększenie skuteczności syntezy enzymów
Atenuator operonu trp, działa w przypadku:
inizia ad imparare
bisyntezy tryptofanu, histydyny, leucyny, treoniny, fenyloalaniny
Gdzie stwierdzona interferencja RNA?
inizia ad imparare
u wszystkich eukariontów
Interferencja RNA - czyje komplementarne działania?
inizia ad imparare
siRNA i miRNA z mRNA
Obecność siRNA co chroni i przed czym?
inizia ad imparare
Chroni komórkę przed obcym kwasem nukleinowym
W typowej komorce ludzkiego ciała w ciągu całego życia, ekspresji ulega ile procent zawartych w niej genow?
inizia ad imparare
20
Co ma każda komórka organizmu wielokomórkowego?
inizia ad imparare
Identyczny zestaw genow (wyjatek: komorki produkujace przeciwciala)
Co to motyw?
inizia ad imparare
Specyficzna konfiguracja umożliwiająca dokładne i stabline wiązanie z odpowiednimi regionami helisy DNA
Jakie 3 motywy wyróżniamy?
inizia ad imparare
Helisa-skręt-helisa, palec cynkowy, suwak leucytowy
Gdzie występuje zamek leucynowy?
inizia ad imparare
W białkach jun i fos, które funkcjonują jako jądrowy czynik transkrypcyjny - heterodimer AP-1
Co zawiera zamek leucynowy?
inizia ad imparare
2 helisy, w obrębie których jest ok. 35 reszt aminokwasowych. Wytwarza dimer
Występowanie motywu helisa-skręt-helisa
inizia ad imparare
Motyw ten zawierają białka kodowane przez geny homeopatyczne
Przykład alternatywnego splicingu
inizia ad imparare
ekspresja genu troponiny T, ekspresja genu sxl
gen sxl w co jest zaangazowany
inizia ad imparare
w determinacje płci u D. melanogaster
Ile genów u człowieka podlega alternatywnemu splicingowi?
inizia ad imparare
2/3 genow
Redagowanie RNA na czym polega
inizia ad imparare
Polega na rearanżacji pojedynczych nukleotydów w obrębie mRNA, ich duplikacji czy insercji
Komórki produkują apoliproteinę B w jakich wersjach?
inizia ad imparare
Apo-b100 (przez wątrobe), Apo-b48 (jelita)
komórki jelita - mRNA?
inizia ad imparare
mRNA jest modyfikowany przez deaminacje cytozyny, w wyniku czego powstaje skorocna wersja bialka Apo-B48(o 48% krotsza)
Co jest odpowiedzialne za różnorodności przeciwciał oraz kontrolę infekcji wirusem HIV-1?
inizia ad imparare
Redagowanie RNA
gdzie jest stosowane redagowanie RNA?
inizia ad imparare
W terapii genowej
Jakie czynniki mają wpływ na stabilność mRNA?
inizia ad imparare
długość ogona poli A, usunięcie struktury czapeczki, san metaboliczny komórki, hormony
Białko jest niekatywne, dopóki?...
inizia ad imparare
Dopóki nie zostanie sfałdowane w strukturę trzeciorzędową
co robią białka opiekuńcze
inizia ad imparare
W sposób odwracalny wiążą się z niepofałdowanym polipeptydem i pomagają mu znaleźć odpowiednią strukturę przestrzenną
Dwie główne grupy białek opiekuńczych
inizia ad imparare
Hsp70, GroEL/groES
Hsp70 - z czym sie wiążą
inizia ad imparare
Wiązą się z hydrofobowym rejonem białka, pozwala na utrzymanie jego otwartej konfromacji.
w czym bierze udzial Hsp70?
inizia ad imparare
W transporcie prez błony kom, łączeniu białek w kompleksy, oraz rozbijaniu agregatów uszkodzonych białek
co umożliwia GroEL/GroES
inizia ad imparare
umożliwia niesfładowanemu białku tworzenie grup z innym ibiałkami
Przez co są katalizowane cięcia proteolityczne?
inizia ad imparare
proteazy
Działanie - cięcie proteolityczne
inizia ad imparare
Usuwane są krótkie fragmenty polipetydu, a powstałą skrócona cząsteczka po sfałdowaniu staje sie bialkiem aktywnym
Inteiny
inizia ad imparare
wewnętrzne segmenty białek, a proces ich usuwanie jest odpowiednikiem usuuwanie intronów z pre-mRNA
gdzie powstaje iRNA?
inizia ad imparare
w jądrze
Transkrypcja u prokariota
inizia ad imparare
Nie jest oddzielona czasowo i przestrzennie, nie podlega modyfikacji konców 3' 5', zachodzi w cytoplaźmie
Za co odpowiedzialne eiF4c?
inizia ad imparare
Wiązanie dużej podjednostki rybosomu
co to chaperony?
inizia ad imparare
białka opiekuńcze
Drugorzędowa struktura białka - wiązania
inizia ad imparare
W skład wiązania peptydowego c=o i N-H. Są one wysoce polarne i stąd wiązanie C-N ma charakter wiązania częściowo podwójnego. Wiązania peptydowe są sztywne i płaskie, oraz faworyzowane są wiązania wodorowe.
Alfa helisa
inizia ad imparare
Prawosketną, 3,6 reszt aminokwasowych na skręt, wiąz. wodorowe między grupami N-h i C=O oddzielonymi 3 aminokwasami, głównie w białkach globularnych, rzadziej fibrylarnych
beta harmonijka
inizia ad imparare
wiąz. wodorowe między C=O i N-H, które są w róznych miejscach łańcucha polipeptydowego. Kilka odcinków łańcucha jeden obok drugiego.
Struktura dywanowa
inizia ad imparare
Beta harmonijka: kilka odcinków łańcucha jeden obok drugiego, łańcuchy boczne raz nad a raz pod "Dywanem"
Struktura o najniższej energii konformacji dla sekwencji aminokwasowej
inizia ad imparare
III rzędowa struktura białek
Która struktura jest stabilizowana oddziaływaniami niekowalencyjnymi między łańcuchami bocznymi?
inizia ad imparare
IIIrz.: siły van der Waalsa, w. wodorowe, mostki solne, oddzialywanie hydrofobowe miedzy niepolarnymi lan. boczn. aminok. alifatycznych i aromatycznych, mostki 2siarczkowe miedzy cysteinami
Apoproteina
inizia ad imparare
Białko bez swojej grupy prostetycznej
W którym aminokwasie znajduje się siarka
inizia ad imparare
w metioninie i w cysteinie
Technika filtracji żelowej
inizia ad imparare
Porównanie czasu elucji badanego białka i elucji białek o znanej masie
Elektroforeza w żelach poliakryloamidowych z siarczanem dodecylu sodu SDS
inizia ad imparare
szybkość ruchu zależna od masy
Siarczan dodecylu sodu SDS - dzialanie
inizia ad imparare
nadaje on wszystkich bialkom ladunek ujemyn, zalezny od masy bialka
Spektometria mas MS
inizia ad imparare
bardzo dokładna, ma źródło jonów, analizator mas, detektor. Jonizowanie wiązka Xe/Ar. Mogą być mierzone tylko białka o wielkości rzędu kilku kDa
Rodzaje spektometrii mas MS
inizia ad imparare
Elektrozapylanie jonizacyjne ESI, laserowa desopcja/jonizacja z wykorzystaniem amtrycy MALDI, ESI-kwadrupol
Eletkrozapylanie jonizacyjne ESI
inizia ad imparare
wytworzenie rozpylonej zawiesiny mocno naładowanych kropelek białka, potem odparowane w celu uzyskania naładowanych joonów białka w fazie gazowej
ESI-kwadrupol
inizia ad imparare
4 pręty z prądem zmiennym o określonej częstotliwości i napięciu i napięciu stałym. Białka mniejsze niż 100 kDA z dokłądnością 0,01%
Mioglobina i hemoglobina
inizia ad imparare
Rodzina białek globinowych, homologi
Ortologi
inizia ad imparare
geny z tej samej rodziny, których produkty u różnych gatunków zachowaly te sama funkcjei to samo znaczenie biochemiczne
Paralogi
inizia ad imparare
geny, ktorych produkty pelnia podobne funkcje ale ewoluowaly niezaleznie
Enzymy rozcinająca białka
inizia ad imparare
trpysyna, proteaza V8, bromek cyjanogenu
Liczba możliwych tripletów
inizia ad imparare
64
Kod genetyczny
inizia ad imparare
zapis infromacji o dziedziczeniu w DNA (lub w RNA u wirusów)
Aminokwasy są kodowane przez więcej niż 1 kodon oprócz:
inizia ad imparare
metioniny, tryptofanu, selenocysteiny i prilizyny
Kodony oznaczające ten sam aminokwas
inizia ad imparare
kodony synonimowe
Kodony zawierają inf. o aminokwasie
inizia ad imparare
kodony sensowne
Ktore kodony są nonsensowne?
inizia ad imparare
kodon stop UAA, UGA, UAG (UGA i UAG czasem kodują selenocysteinę i pirolizynę)
Czym się różni selenosyteina od innych amoinokwasów?
inizia ad imparare
Nie ma odpowiedniej syntetazy łączącej ten aminokwas z odpowiednim tRNASec
syntetaza serylo-tRNA
inizia ad imparare
wprowadza serynędo tRNASec, tam jest ona enzymatycznie fosforylowana i powstaje selenofosforan, następnie przekształca on seryne w selenocysteinę związaną z tRNASec
W genomie człowieka ile selenobiałek?
inizia ad imparare
25
Kod genetyczny trójkowy
inizia ad imparare
1 aminokwas kodowany przez 1 triplet nukleotydów DNA czyli też i kodon mRNA
Kod genetyczny uniwersalny
inizia ad imparare
dany triplet koduje ten sam aminokwas u organizmów/wirusów (wyjątek: mitochondria i chloroplasty)
kod genetyczny niezachodzący
inizia ad imparare
nukleotyd 1 kodonu nie zachodzi na kolejną trójkę - każdy z nukleotydów jest tylko w 1 kodonie
bezprzecinkowy
inizia ad imparare
nie ma dodatkowych nukleotydów między kodonami, inf. odczytowana w sposób ciagly (z lewa na prawo od kodonu start do stop)
wieloznaczny
inizia ad imparare
=zdegradowany. 1 aminokwas moze kodować więcej niż 1 triplet
Czy rozmiar organizmu zależy od ilości DNA w jądrze?
inizia ad imparare
Nie, płazy mają 100razy więcej niż człowiek
Dlaczego niekodujący DNA u eukaroita jest powielany?
inizia ad imparare
Bo zawiera informacje o syntezie różnych RNA i organizacji życia komórki
3 Rodzaje DNA u eukariota
inizia ad imparare
Natychmiastowa renaturacja nici DNA, nici DNA renaturujące wolniej, DNA renatarujące się b. wolno
DNA renatrujące się b. wolno
inizia ad imparare
odpowiada sekwencjom unikalnym, np gen fibroiny jedawbiu - występuje w pojedynczej kopii w haploidalnym genomie jedwabnik
Natychmiastowa renaturacja nici DNA
inizia ad imparare
powtarzalne, satelitarne, występujące w duzej ilosci kopii DNA
Jakie DNA stanowi 10-15% genomu ssaków?
inizia ad imparare
DNA ktore natychmiastowo renaturuje nici
Jakie 3 rodzaje natychmiastowej renaturacji nici DNA
inizia ad imparare
najliczniejsze sekwencje krótkie tandemowe, dłuzsze sekwencje tandemowe, minisatelity
sekwencje krotkie tandemowe, jaka wielkosc
inizia ad imparare
5-10 pz
dluzsze sekwencje tandemowe, jaka wielkosc
inizia ad imparare
100-200 pz
Co w regionie 5'flankującym
inizia ad imparare
geny niezbędne do transkrypcji
Co najbliżej końca 5'?
inizia ad imparare
Sekwencje regulatorowe
budowa genow kodujących białka - co w pozycji ok 100pz?
inizia ad imparare
region promotorowy
budowa genow kodujących białka - co w pozycji ok 30-25pz?
inizia ad imparare
sekwencja TATA/kaseta TATA
sekwencja promotorowa u prokariota
inizia ad imparare
TTGACA
prinbow box
inizia ad imparare
sekwencja TATAAT
co się przyłącza do regionu tata?
inizia ad imparare
Polimeraza RNA III
co w miejscu inicjacji transkrypcji?
inizia ad imparare
Zasada purynowa
co jest za puryną
inizia ad imparare
fragment noekodujący
hnRNA
inizia ad imparare
heterogenny jąderkowy DNA - występuje w niedojrzałym mRNA cytozylowym
sekwencja AATAAA
inizia ad imparare
rozpoznawcza dla odcięcia transkryptu pierwotnego (hnRNA) -> zakończenie transkrypcji w sekwencji poniżej AATAAA w regionie bogatym w pary GC
Podstawa różnicowania się komórek
inizia ad imparare
Niektóre geny ulegają ekspresji tylko w określonych tkankach
house keeping genes
inizia ad imparare
geny kodujące wszechobecne białka, są to geny konstytutywn, występują przez cały okres życia komórki, ich ekspresja zależy od warunkow srodowiska
House keeping genes - wspolne wlasciwosci
inizia ad imparare
stały niski poziom transkrypcji, brak kasety TATA, zawierają liczne, niemetylowane pary CG, obelnośćw niekodującym rejonie 5' jednej/kilku sekwencji GGGGCGGG
Kaseta GC
inizia ad imparare
GGGGCGGG
Pseudogeny
inizia ad imparare
nie podlegają transkrypcji ani translacji

Devi essere accedere per pubblicare un commento.