"rozdz. 27 metody molekularne badania genomu" - drewa

genom człowieka ma jaki zestaw hromosomów?

haploidalny (n=23)

podstawową jednostką strukturalna?

nukleotyd

jakie mamy dwie oddzielne wersję DNA?

DNA genomowy (gDNA), DNA mitochondrialny (mtDNA)

ile gDNA zawiera nukleotydów?

3.08 miliarda nukleotydów

Jaką mamy łączną długość DNA

prawie 1 metr

sekwencje kodujące białka w DNA to?

eksony

eksony są naprzemiennie poprzedzielane sekwencjami niekodującymi jak je nazywamy?

intronami

introny spełniają funkcję?

funkcja kontrolna i stabilizujące strukturę genomu

ile procent DNA to eksony

1.5%

ile procent stanowią introny

25.5%

ile procent stanowią sekwencje DNA niekodujacego?

73%

gdzie występuje mtDNA?

w macierzy mitochondriów

jaką postać ma mtDNA? (kształt)

kuliste cząsteczki

ludzie są heterozygotyczne w 1/500 pz czyli?

różnice między ojcem a synem mogą wynosić 500 000 par zasad w zależności od wielkości chromosomu

projekt poznania ludzkiego genomu

HGP

porównawcza analiza różnych genomów

genomika porównawcza

nauka o wytwarzaniu przez komórki i tkanki białek w różnym okresie rozwoju?

proteomika

nauka o regulacji ekspresji genów na poziomie transkrypcji

transkryptomika

łączenie wyselekcjonowanych fragmentów DNA

rekombinacja DNA

PCR jest formą?

formą klonowania

inna nazwa enzymów restrykcyjnych?

inna nazwa to restryktazy

enzymy restrykcyjne należą do grupy

DNA endonukleaz

gdzie znaleziono jedynie restryktazy naturalnie?

w komórkach bakterii i sinic jako mechanizmy obronne

w jakim miejscu restryktazy tną DNA

w specyficznym dla nich sekwencji

z pomocą czego można łączyć wybrane fragmenty DNA

za pomocą ligaz DNA

jak długa jest sekwencja rozpoznawana przez ligaze DNA?

4-8 pz

jedną jednostka restrykcyjnego to ilość która katalizuje kompletna hydrolizę flagowego DNA o masie 1ug(50 kpz) w ciągu jakiego czasu i jakiej temperaturze?

w ciągu 1 godziny w 37 stopniach

1ug cząsteczki DNA to ile pz

około 50pz

co oznacza gwiazdka przy nazwie enzymu

że działa w specyficznych warunkach

Jaka jest sekwencja rozpoznawana przez EcoRI

GAATTC

Jaka jest sekwencja rozpoznawana przez EcoRI w zmiennych warunkach?

CAATTC, GAATTG, GTATTC

Jakie dwa rodzaje końców pozostawiają w rozciętej cząstce DNA enzymy restrykcyjne?

Tępe i lekkie końce

Tempe końce powstają wtedy gdy?

obie nici naprzeciw siebie przetną się równolegle

Tępe końce powstają wtedy gdy?

obie nici naprzeciw siebie przetną się asymetrycznie (dachówkowo)

lepkie końce 3' są złożone z ilu nukleotydów?

są złożone z 2-4 nukleotydów

lepkie końce 5' są złożone z ilu nukleotydów?

są złożone z z 2-6 nukleotydów

restryktazy można podzielić również na?

Czwórkowe, szóstkowe, ósemkowe

restryktazy czwórkowe rozpoznają

czteronukleotydową sekwencje DNA, występują średnio co 256 pz, trawią bardzo małe fragmenty DNA

Restryktazy szóstkowe rozpoznają

sześcionukleotydową sekwencje DNA o długości 6 nukleotydów. Pojawiają się one średnio co 4096pz, Do użycia tych restryktaz warunki trzeba ustalić eksperymentalnie

Restryktazy ósemkowe rozpoznają

ośmionukleotydową sekwencje, Trawią na bardzo duże fragmenty

Enzymy pochodzące z rożnych szczepów bakterii ale rozpoznające te same sekwencje DNA

izoschizomery

HaeIII

haemophilus aegyptus 5'... CG/CC...3' powstają tępe końce

Hhal

hemophilus haemolyticus 5'... GcG/C...3' 3'jest lepkim końcem