moje 3

Narzędzie do PCR:

termocycler

Składniki do PCR:

matryca DNA, startery, dNTPs, bufor reakcyjny, MgCl2, polimeraza

Skład buforu do PCR:

TrisHCl pH 9.0, KCl, Triton x 100

Etapy PCR i temperatury:

denaturacja 95C, hybrydyzacja 55C, elongacja 72C

Wyjściowe w RT-PCR jest

mRNA

W RT-PCR tworzone jest ... na matrycy...

tworzone jest cDNA na matrycy RNA

Określenie ilości mRNA w próbce za pomocą:

kompetycyjny RT-PCR

Dwie różne pary starterów są używane w:

Nested-PCR (Zagnieżdzony PCR)

Koliste cząsteczki DNA powstałe w wyniku cięcia genomowego DNA enzymami restrykcyjnymi i ligowaniu tch fragmentów ligazą DNA z faga T4) stanowią matrycję w:

Odwróconym PCR

Wizualizacja produktów PCR:

żel agarozowy, barwienie bromkiem etydyny

Mniejsza wartość Ct w RealTime PCR swiadczy o tym że:

matrycy jest dużo

Detekcję produktu amplifikacji PCR w miarę postępu reakcji pozwala metoda:

REALTIME PCR

Fluorofor używany do qPCR

SYBR Green I

qPCR - jeżeli podwojenie ilości matrycy zachodzi z doskonałą wydajnością to odległość między wartościami Ct dla szeregu rozcieńczeń wynosi:

2 do n

Fluorofory reporterowe:

FAM, TET, HEX, ROX, Tamra

Przykłady wyciszaczy:

BHQ1, BHQ2, BHQ3, DABCYL

Sonda, która podczas annealingu wiąże się do docelowej sekwencji i podczas wydłużania jest częściowo wypierana i reporter jest odcinany to:

System TaqMan

Sonda ze spinką do włosów z reporterem i wyciszaczem, która podczas annealingu wiąże się do docelowej sekwencji by rozdzielić reporter i wyciszacz to:

System Beacon

Dwie sondy które wiążą się do sekwencji docelowej w orientacji head-to-tail to:

System Sond Hybrydyzacyjnych

Primer zymogenny kodujący katalityczny DNA jest wydłużany, a gdy katalityczny DNA wiąże się do sondy i rozszczepia reporter i wyciszacz to:

System BD Qzyme

Geny oporności na antybiotyki to np:

amp r, tc r

Glikopeptyd tworzący chelat z jonami miedzi produkowany przez Streptomyces to:

Zeocin

Oporność na Zeocin jest nadawana przez gen:

Sh ble

Organizmy pozbawione zdolności syntezy określonych, niezbędnych do ich wzrostu, skomplikowanych związków organicznych, takich jak witaminy, zasady purynowe czy aminokwasy to:

auksotrofy

Niezbędny do syntezy puryn, tyminy a także glicyny jest gen:

DHFR

Mutanty DHFR- do wzrostu wymagają:

puryn, tyminy i glicyny

3 główne typy sond:

cDNA, genomowe DNA, oligonukleotydowe

Sondy genomowe są używane w technikach:

spaceru po chromosomach, skoku po chromosomach, ZOO BLOT

użyteczne przy nieznacznej wiedzy o sekwencji docelowej są sondy:

oligonukleotydowe

Jeżeli sekwencja genomowa badanego organizmu jest dostępna można przeprowadzić przeszukiwanie bazy danych ... w celu znalezienia homologii z dostępną sekwencją sondy

in silico

W bibliotekach (bankach) klonów repliki kolonii lub łysinek są na:

filtrach nitrocelulozowych lub nylonowych

Podczas przeszukiwania banków klonów filtry i sondy są inkubowane w ... w temp... przez...

roztworze hybrydyzacyjnym w temp. 65-68C przez ok. 12 godzin

Przeszukiwanie bibliotek genowych przez PCR to

metoda kombinatoryczna

W przeszukiwaniu bibliotek cDNA przy pomocy specyficznych przeciwciał są wykorzystywane:

królicze surowice poliklonalne lub przeciwciała monoklonalne

W przeszukiwaniu bibliotek cDNA przy pomocy specyficznych przeciwciał detekcja przeciwciał jest:

radioaktywna, chemiluminescencyjna lub chromogenna

Metody analizy klonów technikami translacji to:

HART i HRT

Metoda Southern Blotting dotyczy hybrydyzacji:

DNA

Metoda Northern Blotting dotyczy hybrydyzacji:

RNA

Metoda Western Blotting wykorzystuje oddziaływanie:

białko-przeciwciało

Metoda Far Western Blotting wykorzystuje oddziaływanie:

białko-białko

Przykłady baz danych dostępnych w internecie:

GenBank, EMBL, DDBJ

Przyjład bazy danych z białkami:

UniProt

Efekt w bioinformatyce:

GIGO